VirtualDub фриварен, слегка аскетичен по интерфейсу, но вполне сойдёт для простой работы.. Или для нестандартной..
..чтобы ю-туб не курочил видео, его нужно выкладывать в формате 320x240x15fps, с DivX/Xvid потоком. Звук в mp3 разумного битрейта, без изысков. Полагаться на ютубовскую конвертацию особо не стоит.